Трансграничный регион включает в себя следующие территории:
Латвия: Латгале
Литва: Утенский, Вильнюсский и Алитусский уезды
Беларусь: Гродненская и Витебская области.

Кроме того, следующие территории признаются смежными :
Литва: Каунасский и Паневежский уезды
Беларусь: Минская и Могилевская области, город Минск.

Финансирование, предназначенное для смежных областей, не превышает 20% совокупных затрат Программы.